Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Q9D8Q6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D8Q6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms