Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Alkbh4Q9D8F1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Alkbh4Q9D8F1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms