Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmigd1Q9D7L8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms