Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms