Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D7E4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms