Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc52a3Q9D6X5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc52a3Q9D6X5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms