Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmtm5Q9D6G9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms