Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9bQ9D6E4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms