Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam227bQ9D518 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms