Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf6Q9D4J7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms