Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms