Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph14Q9D3W1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph14Q9D3W1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms