Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms