Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms