Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl53Q9D1H8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms