Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tspan11Q9D1D1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms