Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ube2cQ9D1C1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms