Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mrpl28Q9D1B9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Mrpl28Q9D1B9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Mrpl28Q9D1B9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Mrpl28Q9D1B9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Mrpl28Q9D1B9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Mrpl28Q9D1B9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Mrpl28Q9D1B9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Mrpl28Q9D1B9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Mrpl28Q9D1B9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Mrpl28Q9D1B9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Mrpl28Q9D1B9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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