Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd3Q9D176 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms