Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ift27Q9D0P8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ift27Q9D0P8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ift27Q9D0P8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ift27Q9D0P8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ift27Q9D0P8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ift27Q9D0P8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ift27Q9D0P8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ift27Q9D0P8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ift27Q9D0P8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ift27Q9D0P8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ift27Q9D0P8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ift27Q9D0P8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ift27Q9D0P8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ift27Q9D0P8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ift27Q9D0P8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ift27Q9D0P8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ift27Q9D0P8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ift27Q9D0P8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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