Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms