Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms