Protein–RNA interactions for Protein: Q9D061

Acbd6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd6Q9D061 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acbd6Q9D061 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acbd6Q9D061 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms