Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc47Q9D024 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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