Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CenpnQ9CZW2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CenpnQ9CZW2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms