Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Thumpd2Q9CZB3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms