Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prelid3bQ9CYY7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms