Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim13Q9CYB0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim13Q9CYB0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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