Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Bud23Q9CY21 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Bud23Q9CY21 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Bud23Q9CY21 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Bud23Q9CY21 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Bud23Q9CY21 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bud23Q9CY21 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms