Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx7Q9CY18 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms