Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Xrcc3Q9CXE6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Xrcc3Q9CXE6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Xrcc3Q9CXE6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Xrcc3Q9CXE6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Xrcc3Q9CXE6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Xrcc3Q9CXE6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Xrcc3Q9CXE6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Xrcc3Q9CXE6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Xrcc3Q9CXE6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Xrcc3Q9CXE6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Xrcc3Q9CXE6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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