Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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