Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms