Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tdrd12Q9CWU0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd12Q9CWU0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms