Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms