Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BccipQ9CWI3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms