Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms