Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms