Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snw1Q9CSN1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms