Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q9CRC3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9CRC3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms