Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CR55 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9CR55 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CR55 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CR55 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CR55 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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