Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms