Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PompQ9CQT5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms