Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atp5f1Q9CQQ7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atp5f1Q9CQQ7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atp5f1Q9CQQ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atp5f1Q9CQQ7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atp5f1Q9CQQ7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atp5f1Q9CQQ7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atp5f1Q9CQQ7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Atp5f1Q9CQQ7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atp5f1Q9CQQ7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atp5f1Q9CQQ7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atp5f1Q9CQQ7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atp5f1Q9CQQ7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Atp5f1Q9CQQ7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atp5f1Q9CQQ7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atp5f1Q9CQQ7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms