Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nudt21Q9CQF3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms