Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms