Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms