Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpsQ9CQC2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms