Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc5Q9CQA1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms