Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms